[Hpc-forum] SIESTA segmentation fault - hiba

[Ferenc Bartha]

Kedves Krisztian!
Ez gyanusan nez ki:
> InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =   300.000   309.204 Ry

ÜdvFeri
------------:
Dr. Ferenc BARTHA, tel: 62/54-6821, E-mail: barthaf at sol.cc.u-szeged.hu
SKYPE: ferenc.bartha, WWW: http://www.staff.u-szeged.hu/~barthaf/
SZTE DNT - High Performance Computing Group
   6725 Szeged, Tisza Lajos krt. 113 (Szikra u. 2.)
SZTE, Department of Medical Chemistry, 6720 Szeged, Dóm tér 8.

----- Original Message ----- 
From: "Krisztián Lengyel" <lengyel.krisztian at wigner.mta.hu>
To: <hpc-forum at listserv.niif.hu>
Sent: Monday, September 07, 2015 9:23 AM
Subject: [Hpc-forum] SIESTA segmentation fault - hiba


Tisztelt listatagok!

"Egy kérdéssel szeretnék a SIESTA szoftver ismerőihez/használóihoz
fordulni. A budapesti számítógépen végzek kristályszerkezeti
számításokat egy 810 atomot tartalmazó szupercellán. A DM számítás,
amivel előállítom a szerkezeti optimalizáláshoz szükséges kiindulási
DM fájlt rendesen lefut. Ezután azonban a CG futtatásnál a "Begin CG
move =      0" rész normálisan befejeződik (tehát a kiindulási DM fájl
jó), azonban a  "Begin CG move =      1" résznél egyszer csak azt írja
ki:

Density Matrix sparsity pattern changed.
InitMesh: MESH =   144 x   144 x   450 =     9331200
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =   300.000   309.204 Ry
2 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)

És itt a program egy segmentation fault hibával leáll. A SIESTA
fórumon találtam egy utalást arra, hogy a program által megnyitott
fájlok száma sajnos nagyon megnőhet és elérheti az adott gép
engedélyezett maximumát, ami nálunk 1024. Ugyanez a hiba előállt a
siesta/3.1-intel és a siesta/3.2-intel modulok betöltésekor is.
Érdeklődni szeretnék, hogy találkozott-e már valaki ezzel a hibával
vagy esetleg tudja-e, hogy mit ronthattam el?

Segítségeteket előre is köszönöm!
Lengyel Krisztián

_______________________________________________
Hpc-forum mailing list
Hpc-forum at listserv.niif.hu
https://listserv.niif.hu/mailman/listinfo/hpc-forum