[Hpc-forum] SIESTA segmentation fault - hiba
Krisztián Lengyel
lengyel.krisztian at wigner.mta.hu
2015. Sze. 7., H, 09:23:52 CEST
Tisztelt listatagok!
"Egy kérdéssel szeretnék a SIESTA szoftver ismerőihez/használóihoz
fordulni. A budapesti számítógépen végzek kristályszerkezeti
számításokat egy 810 atomot tartalmazó szupercellán. A DM számítás,
amivel előállítom a szerkezeti optimalizáláshoz szükséges kiindulási
DM fájlt rendesen lefut. Ezután azonban a CG futtatásnál a "Begin CG
move = 0" rész normálisan befejeződik (tehát a kiindulási DM fájl
jó), azonban a "Begin CG move = 1" résznél egyszer csak azt írja
ki:
Density Matrix sparsity pattern changed.
InitMesh: MESH = 144 x 144 x 450 = 9331200
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) = 300.000 309.204 Ry
2 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)
És itt a program egy segmentation fault hibával leáll. A SIESTA
fórumon találtam egy utalást arra, hogy a program által megnyitott
fájlok száma sajnos nagyon megnőhet és elérheti az adott gép
engedélyezett maximumát, ami nálunk 1024. Ugyanez a hiba előállt a
siesta/3.1-intel és a siesta/3.2-intel modulok betöltésekor is.
Érdeklődni szeretnék, hogy találkozott-e már valaki ezzel a hibával
vagy esetleg tudja-e, hogy mit ronthattam el?
Segítségeteket előre is köszönöm!
Lengyel Krisztián
További információk a(z) Hpc-forum levelezőlistáról