[Hpc-forum] SIESTA segmentation fault - hiba

Krisztián Lengyel lengyel.krisztian at wigner.mta.hu
2015. Sze. 7., H, 09:23:52 CEST


Tisztelt listatagok!

"Egy kérdéssel szeretnék a SIESTA szoftver ismerőihez/használóihoz
fordulni. A budapesti számítógépen végzek kristályszerkezeti
számításokat egy 810 atomot tartalmazó szupercellán. A DM számítás,
amivel előállítom a szerkezeti optimalizáláshoz szükséges kiindulási
DM fájlt rendesen lefut. Ezután azonban a CG futtatásnál a "Begin CG
move =      0" rész normálisan befejeződik (tehát a kiindulási DM fájl
jó), azonban a  "Begin CG move =      1" résznél egyszer csak azt írja
ki:

Density Matrix sparsity pattern changed.
InitMesh: MESH =   144 x   144 x   450 =     9331200
InitMesh: Mesh cutoff (required, used) =   300.000   309.204 Ry
2 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)

És itt a program egy segmentation fault hibával leáll. A SIESTA
fórumon találtam egy utalást arra, hogy a program által megnyitott
fájlok száma sajnos nagyon megnőhet és elérheti az adott gép
engedélyezett maximumát, ami nálunk 1024. Ugyanez a hiba előállt a
siesta/3.1-intel és a siesta/3.2-intel modulok betöltésekor is.
Érdeklődni szeretnék, hogy találkozott-e már valaki ezzel a hibával
vagy esetleg tudja-e, hogy mit ronthattam el?

Segítségeteket előre is köszönöm!
Lengyel Krisztián



További információk a(z) Hpc-forum levelezőlistáról