[Hpc-forum] LIGGGHTS forditas es futtatas -57570- [1. scaling]

[Rőczei Gábor]

> On 2015 Jul 02, at 10:11, Ferenc Bartha <barthaf at sol.cc.u-szeged.hu> wrote:
> 
> Kedves Forum es kulonosen David!
> 
> [1. scaling]
> Forditottam egy full MKL verziot (FFTW is MKL). Ezzel az altalad alabb jelentett skalazodasi hibat nem tapasztaltam, sem a kis, sem a nagy rendszeredre. Monoton csokkent a "Loop time" az MPI szalak novelesevel. (exclusive-ban futtatam)
> 
> next: [2. scaling]
> Meg ellenoriznem kell, hogy az altalad keszitett binaris-e az oka annak, hogy neked maskepp jott ki, vagy eppen szerencsetlenul belefutottal valami tars programba, esetleg zombiba es az fogta meg a szamolast. Hamarosan megnezem es jelentem.
> 
> next: [3. CUDA]
> Az mca hibauzenetekkel, ugy emlekszem, hogy Debrecenben talalkoztam (intel/openmpi). A GPU-kon Intel processzor van, csak ugy, mint Debrecenben, itt lehet a kozos pont. Meg fogom nezni a szegedi GPU-n es a BP2-n is, hogy mi a megoldas. Rovidesen.

A szegedi GPU gépekben nincsen Infiniband kártya és emiatt van ez a hibaüzenet:

[gpu1.szeged.hpc.niif.hu:12750] mca: base: component_find: unable to open /opt/nce/packages/global/openmpi/1.6.3-intel/lib/openmpi/mca_btl_openib: libosmcomp.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory (ignored)

Az mpirun-nak paraméterként meg kell adni, hogy ne próbáljon meg Infiniband-et használni. Példa:

mpirun --mca btl ^openib program

Gábor