[Hpc-forum] Maple Grid jobok futtatása -46439-

[Gábor Rőczei]

Kedves Sári Judit!

On 30 Sep 2014, at 10:05, Judit Sári <juditsari at gmail.com> wrote:

> Tisztelt Lista!
> 
> Maple Grid jobok futtatása kapcsán többször is előfordult, hogy a következő hibaüzeneteket kaptam, akár több, akár csak 1 node-on szerettem volna a jobot indítani:
> 
> Picked up _JAVA_OPTIONS: -Xms1g -Xmx1g
> Picked up _JAVA_OPTIONS: -Xms1g -Xmx1g
> Launching on 24 nodes
> Error node cn30.szeged.hpc.niif.hu:2000 is busy.
> 
> vagy
> 
> Launching on 24 nodes
> Error inviting node cn24.szeged.hpc.niif.hu:2000. Is the hostname and port correct? - (Connection refused)
> 
> A script file-ban a kötelező/szokásos részeken  (név, idő, stb) csak a következő utasítások szerepeltek (1 vagy 24 node-ra külön)
> .....
> #SBATCH -N 1
> #SBATCH --ntasks-per-node=1 / 24
> #SBATCH --licenses=maplegrid:1 
> ......
> 
> Mi okozhatja ezt a problémát? Találkozott-e már hasonló problémával valaki esetleg?

A régebbi Maple jobjai esetén nem haltak meg a ${MAPLE}/toolbox/Grid/bin/startserver által elindított java proceszek. Ezek okozták a fenti hibákat. Most leállítottam őket a problémás gépeken.

Ha legközelebb ilyet tapasztal akkor érdemes a job script elején elhelyezni egy ilyen parancsot:

ps aux | grep -i maple

Ez ki fogja írni, hogy kinek a nevében fut. Ha az Ön nevében akkor egy kill paranccsal meg tudja őket ölni.

kill -KILL PID

A SLURM-ös Maple jobok futása után lefut egy processz termináló script, de ez valamiért nem működött jól. Picit módosítottam most rajta. Abban bízok, hogy ez segíteni fog és nem fognak ott maradni a régi processzek.

Üdvözlettel,

        Rőczei Gábor