[Hpc-forum] MPI problemak

[Tom Hornos]

Kedves felhasználók!

A szupergépeken az ajánlott MPI, modul és fordítókörnyezet
automatikusan beállítódik a globális profile alapján.

Kérem, hogy ellenőrizzétek a lokális .bashrc .bash_rpofile vagy
.profile fájlokat, mert ha valaki itt felül definiál valamit, azon nem
tudunk segíteni.

A telepített programok, beleértve az MPI környezetet is, használatának
egyetlen módja a module rendszer. Ez a megfelelő környeztet minden
alkalmazáshoz beállítja.

A debreceni gépre belépve a következő modulok érhetők el:

DEBRECEN[service0] ~ (0)$ module lit
Currently Loaded Modulefiles:
  1) nce/common                  3) intel/cmp/2011_sp1.11.339   5)
intel/ipp/2011_sp1.11.339   7) nce/niif/intel              9)
niif/debrecen
  2) nce/global                  4) intel/mkl/2011_sp1.11.339   6)
intel/2011_sp1              8) sgi/mpt/2.04

Az mpicc és mpicxx fordítók az intel fordítót használják. Kérem
próbáljátok meg újra a fordítást és a futtatást.

Fontos, hogy a node-okat egészben foglaljátok le, pl. 4 node
lefoglalása (12 core van egy compute egységben):

#$ -pe mpi 48
#$ -l exclusive=true
#$ -R y

mpirun ...


Üdv
-- 
Tom Hornos, PhD

GPG: https://dl.dropbox.com/u/14292474/BF698BDE.asc
Howto: http://www.enigmail.net/documentation/quickstart.php