[Hpc-forum] mpich install problem?

Rőczei Gábor roczei at niif.hu
2013. Jún. 20., Cs, 11:19:50 CEST


Kedves Tamás,

A lenti megoldás azért nem működik, mert Debrecenben már be lett vezetve az új NCE module környezet és abban nincs benne a mpich2-x86_64 modul. 

Az alapértelmezett SGI MPI (MPT)-vel nem tudtad lefordítani a programodat? 

Ezek az SGI MPI-os parancsok:

DEBRECEN[service0] ~ (0)$ type mpicc
mpicc is /opt/nce/packages/global/sgi/mpt/2.04/bin/mpicc
DEBRECEN[service0] ~ (0)$ type mpirun
mpirun is /opt/nce/packages/global/sgi/mpt/2.04/bin/mpirun
DEBRECEN[service0] ~ (0)$ 

MPICH2-t senkinek sem javasoljuk, mert nem tudja használni az Infiniband kapcsolatot. Ha csak MPICH2-vel tudod lefordítani akkor a .bashrc fájlodba tedd bele ezt és jó lesz:

module use /usr/share/modules/modulefiles
module load mpich2-x86_64

Gábor

On 2013.06.19., at 10:21, Tamas Hegedus wrote:

> Sziasztok!
> 
> Egy mpich-et használó programot szeretnék futtatni.
> 
> A debreceni gépen beállítottam ezt a környezetet a leírt módon.
> mpi-selector --set mpich2-x86_64
> module clear
> logout
> login:
> ModuleCmd_Load.c(208):ERROR:105: Unable to locate a modulefile for 'mpich2-x86_64'
> 
> ???
> 
> ---
> Mivel kell egy modulee clear, s a szegedi gépen openmpi-os feladataim futnak, ott nem próbáltam még ki.
> 
> Előre is köszönöm a segítséget, ötleteket,
> Tamas
> 
> 
> -- 
> Tamas Hegedus, PhD
> Senior Research Fellow
> MTA-SE Molecular Biophysics Research Group
> Hungarian Academy of Sciences  | phone: (36) 1-459 1500/60233
> Semmelweis University          | fax:   (36) 1-266 6656
> Tuzolto utca 37-47             | mailto:tamas at hegelab.org
> Budapest, 1094, Hungary        | http://www.hegelab.org
> 
> _______________________________________________
> Hpc-forum mailing list
> Hpc-forum at listserv.niif.hu
> https://listserv.niif.hu/mailman/listinfo/hpc-forum




További információk a(z) Hpc-forum levelezőlistáról