[Hpc-forum] uj MOPAC (Autodock, Amber)

[Ferenc Bartha]

Kedves MOPAC Felhasznalok!

Megneztem a par napja megjelent uj MOPAC verziot.

Kaotikus, egyelore nem installalom kozpontilag, remelhetoleg tisztulni fog, 
majd akkor lepek.

Maszekban lehet probalni, de arra figyeljetek, hogy a brazilok (bizonyara 
csak nehany reszben) parhuzamositottak. Ez azt jelenti, hogy az 
OMP_NUM_THREADS kornyezeti valtozonak megfelelo szamu OPENMP (SMP) szal 
indul el. Ez nagyon veszelyes, ha nem a  -pe openmp kornyezetben iditjatok. 
A pe openmp eseten a NIIF gepek ezt automatikusan allitjak, mas (pl. serial 
job-nal) explicite be kell irni, export OMP_NUM_THREADS=1, egyebkent 
belathatatlan kovetkezmenyek lesznek.

P.S.: Az uborkaszunet mellett/ellenere jelzem, hogy Szegeden a MOPAC2012, 
Autodock4 es Amber12&AmberTools13 a
/opt/nce/packages/global
helyen elerheto kiserleti jelleggel.  Varom az eszreveteket!

ÜdvFeri
------------:
Dr. Ferenc BARTHA, tel: 62/54-6821, E-mail: barthaf at sol.cc.u-szeged.hu
SKYPE: ferenc.bartha, WWW: http://www.staff.u-szeged.hu/~barthaf/
SZTE DNT - High Performance Computing Group, 6725 Szeged, Szikra u. 2.
SZTE, Department of Medical Chemistry, 6720 Szeged, Dóm tér 8.

----- Original Message ----- 
From: "Ferenc Bartha" <barthaf at physx.u-szeged.hu>
Sent: Thursday, August 01, 2013 9:28 AM
...
> Ugynakkor a MOPAC2012 oldalát megnézve, most azt látom, hogy ujabban 
> 64bit-es verziot csinaltak. A dolog ellentmondasos (mas van a download 
> oldalon, mas a letoltott csomag "Installation instructions.txt"-ben), de 
> bizzunk abban, hogy tenyleg 64bit-es az uj exe, mindjart lecserelem, vagy 
> melle rakom a masiknak, meg nem tudom, majd irok.